تأليف مسكن الفؤاد لم يكن وليد حالة علمية بحتة يقررها واقع الدرس والتدريس، أو تمليها حاجة المناظرات الحوزوية بقدر ما كان افرازاً لحالة وجدانية عاطفية عاشها الشهيد الثاني بكل جوارحه وأحاسيسه وتفاعل معها تفاعلا إيجابيا طيلة حياته الشريفة، فقد ذكرت أغلب المصادر التي ترجمت للشهيد أنه ابتلي بموت أولاده في مقتبل أعمارهم حتى أصبح لا يثق ببقاء أحد منهم.
لقد واجه الشهيد الثاني حالة الحرمان العائلي بأسمى آيات الصبر والجلد فألف كتابه مسكن الفؤاد وقلبه يقطر ألما وحسرة وهو يرى أولاده أزهاراً يانعة تقطف أمام عينيه.
فلذلك جمع المؤلف في هذه الرسالة جملة من الآثار النبوية وأحوال أهل الكمالات العلية، ونبذة من التنبيهات الجلية، ما ينجلي به الصدأ عن قلوب المحزونين، وتنكشف به الغمة عن المكروبين، بل تبتهج به نفوس العارفين.